Представитель Google Джон Мюллер на днях напомнил, что при удалении HTTP-версии страницы при помощи соответствующего инструмента в Search Console все другие варианты URL также будут удалены. Именно поэтому Google не рекомендует так делать.
Наилучшим вариантом Мюллер считает отправку запроса на удаление/деиндексацию отдельных некачественных URL. Обсуждение этого вопроса читайте здесь.
Источник: Search Engine Roundtable